Với đội ngũ chuyên gia và cộng tác viên có hơn 20 năm kinh nghiệm thực tế về nghiên cứu tài nguyên, sinh vật biển và rừng ngập mặn trên khắp cả nước, CCD đang hợp tác và hỗ trợ nhiều đối tác thực hiện các chương trình điều tra đa dạng sinh học, đánh giá nguồn lợi sinh vật biển và giám sát các hệ sinh thái, các loài sinh vật trên toàn vùng biển Việt Nam. Hiện tại CCD đang thực hiện các hoạt động điều tra, giám sát tài nguyên sinh vật, tập trung vào các lĩnh vực chính như:
CCD đang tích cực phối hợp với một số đối tác khoa học chính như Viện Nghiên cứu Hải sản (RIMF), Viện Hải Dương học (IO), Viện Tài nguyên và Môi trường biển (IMER) và nhiều đối tác quốc tế khác.